Řízení hospodaření s energiemi a optimalizace jejich spotřeby je pro Vodakvu dlouholetou prioritou. Společnost je certifikovaná dle normy ISO 50001 na všechny činnosti i pracoviště. Pravidelně detailně monitoruje spotřebu energií v jednotlivých objektech, vyhledává možné úspory a zavádí provozní opatření na její snížení. Každý rok realizuje řadu investic s cílem další optimalizace spotřeby energií. Dlouhodobě využívá obnovitelné zdroje, velké úpravny vytápí pomocí tepelných čerpadel, na čistírně v Karlových Varech vyrábí z bioplynu z čistírenských kalů elektřinu i teplo, provozuje i vodní elektrárnu.

Od roku 2023 realizuje Vodakva projekty týkající se instalace fotovoltaických elektráren na vybraných provozovaných objektech.  Všechny instalace jsou zvažovány pro okamžitou spotřebu, bez přebytků či akumulace energie v bateriových úložištích. Navrhovaný výkon tak vychází z nejnižší stálé spotřeby v objektu. V roce 2024 se dokončila fotovoltaická elektrárna o celkovém výkonu 9,9 kWp na čistírně odpadních vod v Boru u Tachova. Na jaře letošního roku byl dokončen další fotovoltaický systém. Je umístěný na střeše provozní budovy čistírny odpadních vod Chodová Planá a jeho celkový výkon je 14,72 kWp.